Доктор Лэнгдон преподает в университете. Он является известным специалистом по религиозным символам, поэтому его привлекают к расследованию странного убийства сотрудника Лувра. Жак Соньер был обнаружен на своем рабочем месте убитым и обнаженным в позе человека да Винчи. На его теле присутствовали непонятные символы. Это была подсказка, которую Жак оставил перед смертью.
Роберт Лэнгдон углубляется в изучение картин Леонардо да Винчи и нащупывает след. Он уверен, что тайна убийства скрыта в работах гения. Профессор знакомится с внучкой покойного. Софи потеряла брата и родителей в автомобильной аварии, теперь она очень хочет разобраться в смерти деда. При этом на саму Софи и Роберта падает подозрение в убийстве. Они должны разгадать загадку и снять с себя все обвинения.
В результате своих поисков Роберт и Софи обнаруживают ключ, знакомый девушке с детства. По дороге в посольство за главными героями начинает гнаться полиция, но им удается скрыться на такси. На ключе обнаруживается надпись, она означает адрес банка Цюриха. Там Лэнгдон и Софи в ячейке для хранения обнаруживают шкатулку. В ней спрятан криптекс, который необходимо разгадать.
Погоня за Софи и Робертом продолжается. Вначале их прячет у себя руководитель банка. Но Андре Верне узнает об обвинениях в адрес беглецов и о том, что убийств уже три. Он угрожает главным героям, но тем вновь удается бежать. Они отправляются к человеку, который знает много тайн Приората Сиона. Это Тибинг. Пока он разговаривает с доктором Лэнгдоном, его слуга смотрит новости по телевизору с информацией о беглецах и призывает своего хозяина выгнать их из дома. Софи рассказывает о краеугольном камне, найденном в банке.
В это время в дом проникает монах Сайлас. Он нападает на профессора и хочет забрать их реликвию. Тибингу удается перехитрить и оглушить монаха. Пока все это происходит, к дому является полиция, они готовы начать штурм здания. Они слышат выстрел и начинают операцию по захвату.
Дворецкий Реми, его хозяин Тибинг, а также Софи с Робертом и монахом незаметно покидают дом и отправляются в аэропорт. Они летят в Англию. При помощи зеркала им удается прочесть надпись на шкатулке. Теперь им необходимо отправиться к могиле рыцаря. Но полиция Франции уже связалась с английскими властями, чтобы те окружили аэропорт. Монах, а также Софи с Робертом успевают спрятаться. Полиция не арестовывает Тибинга, так как к нему нет претензий. Им нужен лишь профессор и внучка сотрудника Лувра.
Пока Роберт и Тибинг пытаются разгадать загадку с надгробиями в Темпле, появляется Сайлас. Дворецкий заодно с монахом, он развязал и освободил его. Лэнгдону приходится отдать криптекс злому монаху. Реми рассказывает, что он – Учитель, которому монах поклоняется и выполняет все поручения. Но теперь Сайлас ему не нужен и он убивает своего помощника.
Софи и Роберт продолжают свои поиски. Им необходимо отправиться к могиле Исаака Ньютона, именно он и был рыцарем. Там их ждет очередной сюрприз. Похитители Тибинга назначают им встречу в саду, но выясняется, что сам Тибинг и есть Учитель. Он виновен в убийстве Жака Соньера и остальных. Он хочет забрать реликвию себе и угрожает профессору и Софи.
Лэнгдон блефует и говорит, что давно разгадал тайну. Он просит отпустить Софи. Чтобы спасти девушку и отвлечь внимание злодея, Роберт роняет криптекс, за которым тут же бросается Тибинг. Но таинственный предмет падает и разбивается. Тибинга арестовывают. Теперь Лэнгдон знает, что в криптексе было зашифровано слово «яблоко».
Произведение учит тому, что любая тайна, даже самая сложная, рано или поздно будет раскрыта. А за вред, причиненный другим людям, обязательно будет наказание.
