События повести развиваются накануне и на начальной стадии войны. Главный герой произведения – молодой, красивый, в новом обмундировании лейтенант Плужников, только закончивший военное училище, направляется к постоянному месту службы.
По пути в часть, Николай навещает свой родной дом, где повидался с матерью, сестрой и ее подружкой.
Конечная цель маршрута лейтенанта – Брестская крепость, в которой ему предписано нести службу. Уже на подступах к крепости Плужников все чаще слышит разговоры о подготовке немцев к нападению и начале войны. Но многие горожане не верят этим слухам и уповают на мощь Красной Армии, которая быстро разгромит врага.
Перед прибытием к месту службы Николай повстречался с девушкой Миррой, которая становится его попутчицей. Прибыв в часть, лейтенанту предоставляют комнату для временно прибывающих офицеров и обещают разобраться с внесением его в списки полка на следующий день.
Рано утром крепость начинают бомбить немцы. Плужников оказывается в самом очаге боевых действий. Кругом гибнут солдаты и мирные жители. Становится очевидным, что началась война. С несколькими незнакомыми бойцами лейтенанту удается принять бой с немцами и отстоять одно из зданий.
Но бои не прекращаются. Проходят дни. Немцы практически завладели крепостью. Оставшиеся в живых люди умирают от жажды и полученных ран. Некоторые находят себе убежище в подвалах. В одном из таких подвалов лейтенант находит Мирру и еще двух бойцов, у них нет пищи и боеприпасов. Николай не теряет надежды пробраться к оставшимся живым по подвальным ходам. Но немцы взрывают крепость и все погибают.
Проходит несколько недель. Плужников не сдается. Он делает смелые вылазки и уничтожает немцев. Уже не стало и двух солдат, которые были в бункере. Одного лейтенант убил за предательство, второй сошел с ума от одиночества и погибает от немецких пуль.
В живых остаются только Мирра и Николай. Девушка полюбила молодого человека. Их чувства взаимны, у них будет ребенок. Пытаясь спасти Мирру, Плужников отводит девушку к пленным женщинам. Но немцы раскрывают ее и расстреливают.
Наступает зима, но лейтенант не сдается. Немцы подрывают место, где он прячется, но Николаю удаются выжить.
Николай практически теряет зрение. Только после 1 января 1942 года фашистам удается найти лейтенанта. От отца Мирры Плужников узнает, что немцы разбиты под Москвой.
Лейтенант Николай Плужников выполнил свой солдатский долг. Окровавленный, измученный, слепой он выходит из подвала и с трудом двигается к автомобилю. Вражеский офицер восхищен храбростью советского воина.
Уже через много лет после войны в музейном комплексе Брестской крепости можно услышать рассказ о мужестве русского воина, который в одиночку сражался с врагом.
Известный русский писатель Б.Л.Васильев написал повесть «В списках не значился» в 1974 году. Произведение вошло в литературный золотой фонд.